اولین کار شرکت های تولید کننده یا گروه هایی که مایل به اخذ گواهی گواهینامه های کشاورزی مناسب هستند، به سازمان صدور گواهینامه اعطا می شود. در این روش، روند صدور گواهینامه آغاز می شود. هنگام تکمیل فرم درخواست، سازنده باید نوع محصول یا منطقه تولیدی را که می خواهد گواهی شود، اعلام کند. برای گواهی گواهی خوب کشاورزی و گواهی GLOBALGAP، مطالعات صدور گواهینامه می تواند همزمان انجام شود. بنابراین، تولید کنندگان می توانند هر دو اسناد را در صورت تمایل درخواست دهند. این گواهی برای یک سال معتبر است و باید هر ساله مجددا مورد بازنگری قرار گیرد.

قبل از درخواست صدور گواهینامه های کشاورزی خوب، محصولات کشاورزی یا محصولات کشاورزی که قبلا در منطقه تولید شده اند، باید شناخته شوند، باید تاثیر آنها بر سلامت انسان و محیط زیست مورد ارزیابی قرار گیرد و اگر خطراتی وجود داشته باشد که نمی تواند کنترل شود، این مزرعه نباید در فعالیت های کشاورزی خوب استفاده شود.

تولید کنندگان قبل از اعمال باید ارزیابی خطر را انجام دهند. ارزیابی ریسک؛ نوع خاک، فرسایش، سطح آبهای زیرزمینی و کیفیت، در دسترس بودن منابع آب پایدار، اول استفاده از زمین، آلودگی با انگل ها و دیگر انگل ها و تاثیر آنها در مناطق مجاور. به منظور حفاظت از سلامت خاک، کاهش وابستگی به آفت کش ها و حفظ سلامتی گیاه در حداکثر سطح، باید تولید چرخشی انجام شود.

با توجه به مقررات قوانین کشاورزی خوب، مطالعات صدور گواهینامه مطابق با طبقه بندی محصولات زیر انجام می شود:

تولید محصول

ITU-01: میوه و سبزیجات تازه
İTU-02: محصولات زراعی
ITU-03: گل و گیاهان زینتی
İTU-04: نهال و مهد کودک
ITU-05: چای

تولید حیوانات

İTU-06: پای مرغ، گاو و گوسفند (گاو شیری، گاو گوسفند)
İTU-07: مرغ
ITU-08: هندوئیسم

آبزی پروری

İTU-09: آبزی پروری (ماژول ماهی، مولدووا دوغ)

سازمان صدور گواهینامه باید یک نهاد بازرسی و صدور گواهینامه باشد که توسط وزارت غذا ، کشاورزی و دامپروری مجاز به کار است. شرکت های تولید کننده یا گروه هایی که متقاضی هستند توسط سازمان صدور گواهینامه حسابرسی می شوند و مشاهده می شود که آیا آنها مطابق با معیارهای روشهای خوب کشاورزی کار می کنند یا خیر. ویژگی اصلی سیستم رویه های خوب کشاورزی این است که محصولات کشاورزی را می توان از میدان به جدول مصرف کننده ردیابی کرد. این سیستم کاملاً مبتنی بر ثبت فعالیتها و مراحل تولید شرکتهای تولیدی است. به این ترتیب محصول از لحظه کاشت در مزرعه تا رسیدن به دست مصرف کننده کنترل می شود. سوابق نگهداری شده در جریان ممیزی های داخلی که در طول سال انجام می شود ، نگهداری می شود. اگر اولین بار است که برای دریافت گواهینامه اقدام می کنید ، در صورت امکان ، اطلاعات مربوط به سالهای گذشته را جستجو می کنید.

موسسات صدور گواهینامه بررسی خواهد کرد که آیا تمام فرایندهای اعمال شده از مرحله اول تولید محصولات کشاورزی به جمع آوری و راه اندازی محصول مطابق با معیارهای عملیات کشاورزی خوب است. در طی این بازرسی، هر دو پرونده نگهداری می شود باید مورد بررسی قرار گیرد و در صورت لزوم، تجزیه و تحلیل های آزمایشگاهی باید انجام شود تا مشخص شود کیفیت محصول.
اعطای گواهی گواهینامه های کشاورزی خوب به شرطی است که شرکت این ممیزی ها را تحویل دهد.